Pgpool-IIは、その人生を、石井達夫の個人プロジェクトとしてスタートしました。 そのプロジェクトでは、Pgpool-IIは、単なるコネクションプール用のソフトウェアでした。 そこからPgpoolという名前が由来しました。 最初のバージョンは2003年に公開されました。
2004年にPgpool 1.0がネィティブレプリケーション機能（SQL文ベースのレプリケーション）を搭載してリリースされました。 同じ年に負荷分散機能を搭載し、バージョン3のフロントエンド/バックエンドプロトコルをサポートした2.0がリリースされました。 2005年には自動フェイルオーバ機能を搭載され、マスタースレーブモードがサポートされました。
2006年、PgpoolはPgpool-IIとなりました。 最初の1.0リリースでは、Pgpoolの多くの制限事項が撤廃されました。 たとえば、PostgreSQLサーバ数は2まで、といった制限です。 また、パラレルクエリやPCPコマンド（PCPは、"Pgpool Control Protocol"の略です）といった多くの機能が追加されました。 PgpoolからPgpool-IIへの一番重要な変更は、おそらく個人プロジェクトから、Pgpool Developement Groupが所有するグループプロジェクトになったことでした。